Martínez Camino dijo que el Episcopado no objeta que forme parte del currículo escolar una materia en la que se expliquen los principios constitucionales y las normas de convivencia de los ciudadanos. Ahora bien, si lo que implica es imponer opciones morales en todos los centros escolares, se contradice claramente «el derecho primordial de los padres a educar a sus hijos según sus convicciones».
Respecto a las negociaciones que la Iglesia mantiene con el Ministerio de Educación para el desarrollo reglamentario de la Ley Orgánica de Educación (LOE) en aspectos como la enseñanza de la Religión y el régimen de su profesorado, el portavoz de los prelados estimó que «es posible que se pueda conseguir un mal menor», si bien insistió en que se trata de una «ley mala, que contradice los acuerdos Iglesia-Estado».
La Comisión Permanente expresó su solidaridad con Benedicto XVI tras la polémica provocada por su lección dictada en la Universidad de Ratisbona, que levantó las iras de los sectores islamistas más radicales. Martínez Camino admitió que en Europa puede que se haya instalado el temor y que se expresen «miedos por estar atentos a eventuales reacciones desproporcionadas e injustas» de los radicales islámicos.