En los centros de educación Primaria y Segundaria de Gipuzkoa hay matriculados 194 estudiantes en clases de religión islámica. Según datos del Departamento de Educación, esos alumnos se corresponden con centros públicos, aunque también hay alguno privado, situados en Alegia, Arrasate, Ataun, Azkoitia, Azpeitia, Beasain, Bergara, Deba, Donostia, Eibar, Elgoibar, Errenteria, Getaria, Hernani, Hondarribia, Irun, Lasarte-Oria, Lazkao, Oñati, Ordizia, Urnieta, Zaldibia, Zarautz y Zizurkil.
Un informe publicado el año pasado ofreció una fotografía de las clases de religión islámica en Euskadi. El Estudio Demográfico de la Población Musulmana, realizado por la Unión de Comunidades Islámicas de España, cifró en dos los profesores que existen en Euskadi para esta materia, un número que puede parecer escaso, pero que sin embargo destaca de otras comunidades. Euskadi es una de las cuatro autonomías que ofrece esta asignatura a estudiantes musulmanes de colegios de Primaria, junto con Andalucía, Aragón y Canarias, y Ceuta y Melilla. Ante las dificultades de hallar este perfil profesional, los colectivos musulmanes llegaron a presentar a Educación un listado de candidatos. El Departamento ha defendido que para ser profesor de religión islámica hay que acreditar la formación de Magisterio, como exige la ley para la etapa de Primaria, mientras que en Secundaria se debe contar con licenciatura y un curso especial de capacitación.